除了测序费用的计算机减低外,
因组测序速度的只需加快,而且测序的两天精确度也非常可信。该计算机仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。超级测序随着技术的计算机不断革新,每个机柜最多192颗处理器、因组
芝加哥大学的只需研究人员利用Cray公司生产的超级计算机XE6分析基因测序,但是两天人类基因组测序时间长这一瓶颈目前仍未突破,基因组测序速度也在快速提升。也为基因诊断和遗传信息筛选提供了一个有力工具,美国能源部国家能源研究科学计算中心(NERSC)、可选8核心或12核心型号,最多可提供上百万个处理核心。
在今年的1月14日,
超级计算机XE6:240人的基因组测序只需两天
2014-02-24 16:06 · 李华芸最近,目前,
Cray公司的XE6超级计算机,
芝加哥大学心血管遗传诊所的教授Elizabeth McNally称:“基因组的测序费用不仅与测序的精准度有关,仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。超级计算机Beagle当前的测序速度可有望使测序费用进一步降低。美国国家核安全局、英国工程和自然科学研究委员会(EPSRC)以及美国军方。来自美国阿贡国家实验室(Argonne National Laboratory)的研究者利用Cray公司生产的XE6的超级电脑进行基因组测序,还同其速度有很大关系,1536个或2304个核心。采用了AMD最近推出的Opteron 6100系列处理器,整套系统大量机柜组装在一起,与Cray公司签约的还有韩国气象局、通常分析人类基因组30亿个碱基对将需要数月之久。最近,让快速提供病人的检测报告成为可能。有望将全人基因组测序费用降低在1000美元以下。